MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 plasmid pAS9A-2

Total Repeats: 2345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015561	ATC	2	6	22823	22828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_015561	TGC	2	6	22925	22930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917586
503	NC_015561	AAG	2	6	22978	22983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917586
504	NC_015561	TC	3	6	23002	23007	0 %	50 %	0 %	50 %	333917586
505	NC_015561	TGG	2	6	23010	23015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917586
506	NC_015561	CGA	2	6	23061	23066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_015561	GGC	2	6	23095	23100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_015561	CACCGC	2	12	23137	23148	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_015561	CTG	2	6	23165	23170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_015561	TGC	2	6	23176	23181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_015561	GAGCA	2	10	23199	23208	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
512	NC_015561	TCG	2	6	23223	23228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917587
513	NC_015561	CGG	2	6	23237	23242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917587
514	NC_015561	GAGT	2	8	23270	23277	25 %	25 %	50 %	0 %	333917587
515	NC_015561	CTTG	2	8	23318	23325	0 %	50 %	25 %	25 %	333917587
516	NC_015561	AAC	2	6	23331	23336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917587
517	NC_015561	TCG	2	6	23391	23396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917587
518	NC_015561	CGT	2	6	23494	23499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917587
519	NC_015561	CGAG	2	8	23500	23507	25 %	0 %	50 %	25 %	333917587
520	NC_015561	CA	3	6	23541	23546	50 %	0 %	0 %	50 %	333917587
521	NC_015561	CCG	2	6	23570	23575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917587
522	NC_015561	GGC	2	6	23650	23655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917587
523	NC_015561	GCA	2	6	23660	23665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917587
524	NC_015561	GCT	2	6	23738	23743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917587
525	NC_015561	GTC	2	6	23751	23756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917587
526	NC_015561	TGCCC	2	10	23758	23767	0 %	20 %	20 %	60 %	333917587
527	NC_015561	CGAT	2	8	23776	23783	25 %	25 %	25 %	25 %	333917587
528	NC_015561	TCA	2	6	23806	23811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917587
529	NC_015561	TCC	2	6	23815	23820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917587
530	NC_015561	ATC	2	6	23865	23870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917587
531	NC_015561	GAC	2	6	23907	23912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917587
532	NC_015561	CAT	2	6	23918	23923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917587
533	NC_015561	CGA	2	6	23930	23935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917587
534	NC_015561	ACGAC	2	10	24000	24009	40 %	0 %	20 %	40 %	333917587
535	NC_015561	ATC	2	6	24012	24017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917587
536	NC_015561	AGAACG	2	12	24091	24102	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	333917587
537	NC_015561	AAT	2	6	24171	24176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333917587
538	NC_015561	TTC	2	6	24210	24215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917587
539	NC_015561	TTC	2	6	24261	24266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917587
540	NC_015561	GAA	2	6	24269	24274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917587
541	NC_015561	TTC	2	6	24312	24317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917587
542	NC_015561	CGG	2	6	24329	24334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917587
543	NC_015561	CTG	2	6	24475	24480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917587
544	NC_015561	CCTC	2	8	24637	24644	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
545	NC_015561	CG	4	8	24677	24684	0 %	0 %	50 %	50 %	333917588
546	NC_015561	AAC	2	6	24850	24855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_015561	CCA	2	6	24947	24952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_015561	GTGC	2	8	24981	24988	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
549	NC_015561	CGG	2	6	25099	25104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_015561	GT	3	6	25128	25133	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015561	TG	3	6	25174	25179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
552	NC_015561	GCA	2	6	25291	25296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917589
553	NC_015561	CGC	2	6	25325	25330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917589
554	NC_015561	CGCCGT	2	12	25428	25439	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333917589
555	NC_015561	GCAG	2	8	25485	25492	25 %	0 %	50 %	25 %	333917589
556	NC_015561	GCA	2	6	25494	25499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917589
557	NC_015561	CGC	2	6	25528	25533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917589
558	NC_015561	GCTG	2	8	25623	25630	0 %	25 %	50 %	25 %	333917589
559	NC_015561	GCG	2	6	25639	25644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917589
560	NC_015561	GAT	2	6	25651	25656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917589
561	NC_015561	CGC	2	6	25674	25679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917589
562	NC_015561	GAT	2	6	25680	25685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917589
563	NC_015561	TGC	2	6	25734	25739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917589
564	NC_015561	GGT	2	6	25787	25792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917589
565	NC_015561	ACG	2	6	25837	25842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917590
566	NC_015561	CAT	2	6	25847	25852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917590
567	NC_015561	AGT	2	6	25937	25942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917590
568	NC_015561	CCG	2	6	25965	25970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917590
569	NC_015561	CAT	2	6	25997	26002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917590
570	NC_015561	ACC	2	6	26049	26054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917590
571	NC_015561	CCTG	2	8	26083	26090	0 %	25 %	25 %	50 %	333917590
572	NC_015561	CGC	2	6	26159	26164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917590
573	NC_015561	CGG	2	6	26176	26181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917590
574	NC_015561	GACCG	2	10	26295	26304	20 %	0 %	40 %	40 %	333917590
575	NC_015561	GCC	2	6	26379	26384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917590
576	NC_015561	CCG	2	6	26433	26438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_015561	GGC	2	6	26492	26497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_015561	TCA	2	6	26507	26512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_015561	CCT	2	6	26571	26576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_015561	TACG	2	8	26586	26593	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
581	NC_015561	CTT	2	6	26704	26709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917591
582	NC_015561	TCG	2	6	26832	26837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917591
583	NC_015561	GC	3	6	26853	26858	0 %	0 %	50 %	50 %	333917591
584	NC_015561	GCT	2	6	26874	26879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917591
585	NC_015561	CGTT	2	8	26913	26920	0 %	50 %	25 %	25 %	333917591
586	NC_015561	TGG	2	6	26973	26978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917591
587	NC_015561	GCT	2	6	27032	27037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917591
588	NC_015561	GT	3	6	27087	27092	0 %	50 %	50 %	0 %	333917591
589	NC_015561	GC	3	6	27095	27100	0 %	0 %	50 %	50 %	333917591
590	NC_015561	GTG	2	6	27106	27111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917591
591	NC_015561	TC	4	8	27234	27241	0 %	50 %	0 %	50 %	333917591
592	NC_015561	GGGT	2	8	27276	27283	0 %	25 %	75 %	0 %	333917591
593	NC_015561	TGT	2	6	27292	27297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917591
594	NC_015561	GTG	2	6	27347	27352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917591
595	NC_015561	CGC	2	6	27388	27393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917591
596	NC_015561	GGTGCG	2	12	27416	27427	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	333917591
597	NC_015561	TGG	2	6	27526	27531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917591
598	NC_015561	TGT	2	6	27532	27537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917591
599	NC_015561	GCG	2	6	27635	27640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917591
600	NC_015561	CAG	2	6	27705	27710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917591
601	NC_015561	GC	3	6	27794	27799	0 %	0 %	50 %	50 %	333917592
602	NC_015561	AC	4	8	27844	27851	50 %	0 %	0 %	50 %	333917592
603	NC_015561	CGAT	2	8	28059	28066	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
604	NC_015561	CCT	2	6	28078	28083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_015561	GCGAT	2	10	28220	28229	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
606	NC_015561	GA	3	6	28282	28287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
607	NC_015561	CGTG	2	8	28348	28355	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
608	NC_015561	CTC	2	6	28425	28430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_015561	GCA	2	6	28439	28444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_015561	CT	3	6	28466	28471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
611	NC_015561	TCT	2	6	28507	28512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_015561	CCG	2	6	28534	28539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_015561	TCT	2	6	28570	28575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917593
614	NC_015561	CCT	2	6	28588	28593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917593
615	NC_015561	CCGG	2	8	28613	28620	0 %	0 %	50 %	50 %	333917593
616	NC_015561	CAGCA	2	10	28634	28643	40 %	0 %	20 %	40 %	333917593
617	NC_015561	GCC	2	6	28677	28682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917593
618	NC_015561	GC	3	6	28715	28720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
619	NC_015561	TC	3	6	28731	28736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
620	NC_015561	GGA	2	6	28814	28819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_015561	TCG	2	6	28979	28984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_015561	CGA	2	6	29041	29046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_015561	GAG	2	6	29088	29093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015561	TGT	2	6	29138	29143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_015561	AGCC	2	8	29173	29180	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
626	NC_015561	ACC	2	6	29255	29260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_015561	CA	3	6	29269	29274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
628	NC_015561	ACG	3	9	29288	29296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_015561	GTC	2	6	29297	29302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_015561	CGC	2	6	29547	29552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917594
631	NC_015561	TGCC	2	8	29690	29697	0 %	25 %	25 %	50 %	333917594
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1000	NC_015561	GCG	2	6	46389	46394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917619

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